Как ясно следует из названия данная классификация основана на различиях в агрегатных состояниях применяемых в хроматографии подвижных и неподвижных фаз.  В данной классификации (см. рисунок) все виды подразделяются на 3 основных вида по агрегатному состоянию используемой подвижной фазы: газовая (ГХ, GH), жикостная (ЖХ, LH) и  сверхкритическая флюидная хроматография (подвижная фаза - полярный газ (СО₂, NH₃ и т.д.) сжатый до жидкого состояния) - что совершенно естественно, т.к. именно подвижная фаза растворяя в себе пробу  определяет спектр разделяемых и анализируемых веществ. Совершенно логичным следующим уорвнем классификации является классификация по агрегатному состоянию используемой неподвижной фазы, отвечающей за взаимодействие и разделение веществ.